2003/2004 Eğitim ve Öğretim yılında ilçemiz İmam Hatip Lisesi binasında Yerköy Lisesi adıyla Eğitim-Öğretime başlamıştır. 2004/2005 Eğitim ve Öğretim yılında Selçuk Mahallesinde kapatılan Mehmet Akif Ersoy  İlköğretim Okulu binası okulumuza tahsis edilerek 8 yıl hizmet vermiştir. Kurum adımız, kapatılan Mehmet Akif Ersoy  İlköğretim Okulu´ ndan dolayı "Mehmet Akif Ersoy Lisesi" olarak değiştirilmiştir.

2010 yılında tüm genel liseler ile birlikte okulumuz da Anadolu Lisesine dönüştürülmüştür. Mehmet Akif Ersoy Anadolu Lisesi, 2012/2013 Eğitim-Öğretim yılında TOKİ tarafından ilköğretim okulu olarak yapılan binaya taşınmış ve burada 2.5 yıl eğitim-öğretim vermiştir.

Yerköylü hayırsever sayın Gencay KOYUNBAŞOĞLU, babannesi adına yaptırdığı okul 2015 yılının şubat ayında açılmış olup, İlçe Millî Eğitim Müdürlüğümüz tarafımıza tahsis etmiştir. Mehmet Akif Ersoy Anadolu Lisesi olan okul adımız hayırseverimizin babannesinin adı olan Rabia Koyunbaşoğlu Anadolu Lisesi olarak değiştirilmiştir.